Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apobec2Q9WV35 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apobec2Q9WV35 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apobec2Q9WV35 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Apobec2Q9WV35 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec2Q9WV35 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apobec2Q9WV35 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms