Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pdcd6ipQ9WU78 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd6ipQ9WU78 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd6ipQ9WU78 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd6ipQ9WU78 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Pdcd6ipQ9WU78 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcd6ipQ9WU78 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pdcd6ipQ9WU78 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdcd6ipQ9WU78 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pdcd6ipQ9WU78 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdcd6ipQ9WU78 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Pdcd6ipQ9WU78 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdcd6ipQ9WU78 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcd6ipQ9WU78 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcd6ipQ9WU78 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcd6ipQ9WU78 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcd6ipQ9WU78 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcd6ipQ9WU78 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcd6ipQ9WU78 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcd6ipQ9WU78 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcd6ipQ9WU78 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd6ipQ9WU78 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdcd6ipQ9WU78 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdcd6ipQ9WU78 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pdcd6ipQ9WU78 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pdcd6ipQ9WU78 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pdcd6ipQ9WU78 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcd6ipQ9WU78 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pdcd6ipQ9WU78 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcd6ipQ9WU78 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcd6ipQ9WU78 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pdcd6ipQ9WU78 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms