Protein–RNA interactions for Protein: Q9R098

Hgfac, Hepatocyte growth factor activator, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgfacQ9R098 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HgfacQ9R098 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HgfacQ9R098 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HgfacQ9R098 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HgfacQ9R098 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HgfacQ9R098 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HgfacQ9R098 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HgfacQ9R098 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HgfacQ9R098 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HgfacQ9R098 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HgfacQ9R098 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HgfacQ9R098 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HgfacQ9R098 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms