Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ15

Clec4a, C-type lectin domain family 4 member A, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4aQ9QZ15 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clec4aQ9QZ15 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec4aQ9QZ15 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec4aQ9QZ15 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec4aQ9QZ15 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec4aQ9QZ15 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec4aQ9QZ15 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec4aQ9QZ15 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Clec4aQ9QZ15 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clec4aQ9QZ15 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clec4aQ9QZ15 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clec4aQ9QZ15 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clec4aQ9QZ15 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms