Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad18Q9QXK2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad18Q9QXK2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rad18Q9QXK2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rad18Q9QXK2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rad18Q9QXK2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rad18Q9QXK2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad18Q9QXK2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad18Q9QXK2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms