Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Lsm4Q9QXA5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lsm4Q9QXA5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm4Q9QXA5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lsm4Q9QXA5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lsm4Q9QXA5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm4Q9QXA5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lsm4Q9QXA5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms