Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Rai2Q9QVY8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rai2Q9QVY8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rai2Q9QVY8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rai2Q9QVY8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rai2Q9QVY8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rai2Q9QVY8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rai2Q9QVY8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rai2Q9QVY8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rai2Q9QVY8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rai2Q9QVY8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rai2Q9QVY8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rai2Q9QVY8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rai2Q9QVY8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rai2Q9QVY8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rai2Q9QVY8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms