Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLY0

Socs6, Suppressor of cytokine signaling 6, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs6Q9JLY0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Socs6Q9JLY0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Socs6Q9JLY0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Socs6Q9JLY0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Socs6Q9JLY0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Socs6Q9JLY0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms