Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn15Q9JLG8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Capn15Q9JLG8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Capn15Q9JLG8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Capn15Q9JLG8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Capn15Q9JLG8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Capn15Q9JLG8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn15Q9JLG8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Capn15Q9JLG8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Capn15Q9JLG8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn15Q9JLG8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms