Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cxcl11Q9JHH5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cxcl11Q9JHH5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cxcl11Q9JHH5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cxcl11Q9JHH5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cxcl11Q9JHH5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cxcl11Q9JHH5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cxcl11Q9JHH5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cxcl11Q9JHH5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cxcl11Q9JHH5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cxcl11Q9JHH5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cxcl11Q9JHH5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cxcl11Q9JHH5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cxcl11Q9JHH5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cxcl11Q9JHH5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cxcl11Q9JHH5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cxcl11Q9JHH5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cxcl11Q9JHH5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cxcl11Q9JHH5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cxcl11Q9JHH5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cxcl11Q9JHH5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cxcl11Q9JHH5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cxcl11Q9JHH5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cxcl11Q9JHH5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cxcl11Q9JHH5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cxcl11Q9JHH5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cxcl11Q9JHH5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cxcl11Q9JHH5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cxcl11Q9JHH5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cxcl11Q9JHH5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cxcl11Q9JHH5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cxcl11Q9JHH5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cxcl11Q9JHH5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cxcl11Q9JHH5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cxcl11Q9JHH5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cxcl11Q9JHH5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cxcl11Q9JHH5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cxcl11Q9JHH5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cxcl11Q9JHH5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cxcl11Q9JHH5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cxcl11Q9JHH5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cxcl11Q9JHH5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cxcl11Q9JHH5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cxcl11Q9JHH5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cxcl11Q9JHH5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cxcl11Q9JHH5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cxcl11Q9JHH5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cxcl11Q9JHH5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Cxcl11Q9JHH5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cxcl11Q9JHH5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cxcl11Q9JHH5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cxcl11Q9JHH5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cxcl11Q9JHH5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cxcl11Q9JHH5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cxcl11Q9JHH5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Cxcl11Q9JHH5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cxcl11Q9JHH5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cxcl11Q9JHH5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cxcl11Q9JHH5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cxcl11Q9JHH5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cxcl11Q9JHH5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cxcl11Q9JHH5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cxcl11Q9JHH5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cxcl11Q9JHH5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cxcl11Q9JHH5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cxcl11Q9JHH5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cxcl11Q9JHH5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cxcl11Q9JHH5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cxcl11Q9JHH5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cxcl11Q9JHH5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cxcl11Q9JHH5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cxcl11Q9JHH5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cxcl11Q9JHH5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms