Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap29Q9ERB0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snap29Q9ERB0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snap29Q9ERB0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap29Q9ERB0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap29Q9ERB0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap29Q9ERB0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap29Q9ERB0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snap29Q9ERB0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap29Q9ERB0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap29Q9ERB0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snap29Q9ERB0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snap29Q9ERB0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Snap29Q9ERB0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snap29Q9ERB0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snap29Q9ERB0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snap29Q9ERB0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap29Q9ERB0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap29Q9ERB0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap29Q9ERB0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap29Q9ERB0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap29Q9ERB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snap29Q9ERB0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap29Q9ERB0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap29Q9ERB0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snap29Q9ERB0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms