Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQP6

Arr3, Arrestin-C, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arr3Q9EQP6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arr3Q9EQP6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arr3Q9EQP6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arr3Q9EQP6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arr3Q9EQP6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arr3Q9EQP6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arr3Q9EQP6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arr3Q9EQP6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arr3Q9EQP6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Arr3Q9EQP6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Arr3Q9EQP6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arr3Q9EQP6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arr3Q9EQP6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arr3Q9EQP6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arr3Q9EQP6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arr3Q9EQP6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arr3Q9EQP6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Arr3Q9EQP6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arr3Q9EQP6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arr3Q9EQP6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arr3Q9EQP6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arr3Q9EQP6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Arr3Q9EQP6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arr3Q9EQP6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arr3Q9EQP6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arr3Q9EQP6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arr3Q9EQP6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arr3Q9EQP6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arr3Q9EQP6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms