Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQP6

Arr3, Arrestin-C, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arr3Q9EQP6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Arr3Q9EQP6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Arr3Q9EQP6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Arr3Q9EQP6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Arr3Q9EQP6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Arr3Q9EQP6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Arr3Q9EQP6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Arr3Q9EQP6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Arr3Q9EQP6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Arr3Q9EQP6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Arr3Q9EQP6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Arr3Q9EQP6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Arr3Q9EQP6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Arr3Q9EQP6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Arr3Q9EQP6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Arr3Q9EQP6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Arr3Q9EQP6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Arr3Q9EQP6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Arr3Q9EQP6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Arr3Q9EQP6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Arr3Q9EQP6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Arr3Q9EQP6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Arr3Q9EQP6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Arr3Q9EQP6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Arr3Q9EQP6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Arr3Q9EQP6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Arr3Q9EQP6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arr3Q9EQP6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Arr3Q9EQP6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Arr3Q9EQP6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Arr3Q9EQP6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Arr3Q9EQP6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Arr3Q9EQP6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Arr3Q9EQP6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Arr3Q9EQP6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Arr3Q9EQP6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arr3Q9EQP6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Arr3Q9EQP6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Arr3Q9EQP6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Arr3Q9EQP6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Arr3Q9EQP6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Arr3Q9EQP6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Arr3Q9EQP6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Arr3Q9EQP6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Arr3Q9EQP6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Arr3Q9EQP6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Arr3Q9EQP6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Arr3Q9EQP6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Arr3Q9EQP6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arr3Q9EQP6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Arr3Q9EQP6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Arr3Q9EQP6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Arr3Q9EQP6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Arr3Q9EQP6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Arr3Q9EQP6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Arr3Q9EQP6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arr3Q9EQP6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Arr3Q9EQP6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Arr3Q9EQP6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Arr3Q9EQP6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Arr3Q9EQP6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Arr3Q9EQP6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Arr3Q9EQP6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Arr3Q9EQP6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Arr3Q9EQP6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arr3Q9EQP6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arr3Q9EQP6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arr3Q9EQP6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arr3Q9EQP6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Arr3Q9EQP6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Arr3Q9EQP6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Arr3Q9EQP6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Arr3Q9EQP6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Arr3Q9EQP6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arr3Q9EQP6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Arr3Q9EQP6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Arr3Q9EQP6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arr3Q9EQP6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Arr3Q9EQP6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arr3Q9EQP6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Arr3Q9EQP6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Arr3Q9EQP6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Arr3Q9EQP6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Arr3Q9EQP6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Arr3Q9EQP6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Arr3Q9EQP6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Arr3Q9EQP6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arr3Q9EQP6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Arr3Q9EQP6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Arr3Q9EQP6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arr3Q9EQP6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Arr3Q9EQP6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Arr3Q9EQP6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Arr3Q9EQP6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Arr3Q9EQP6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Arr3Q9EQP6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Arr3Q9EQP6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arr3Q9EQP6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Arr3Q9EQP6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Arr3Q9EQP6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.3 ms