Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r44Q9EQ47 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Vmn1r44Q9EQ47 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vmn1r44Q9EQ47 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r44Q9EQ47 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r44Q9EQ47 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r44Q9EQ47 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r44Q9EQ47 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r44Q9EQ47 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r44Q9EQ47 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r44Q9EQ47 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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