Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TnmdQ9EP64 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TnmdQ9EP64 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TnmdQ9EP64 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TnmdQ9EP64 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TnmdQ9EP64 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TnmdQ9EP64 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TnmdQ9EP64 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TnmdQ9EP64 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms