Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cyp2c55Q9D816 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cyp2c55Q9D816 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cyp2c55Q9D816 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cyp2c55Q9D816 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp2c55Q9D816 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp2c55Q9D816 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cyp2c55Q9D816 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cyp2c55Q9D816 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp2c55Q9D816 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyp2c55Q9D816 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyp2c55Q9D816 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyp2c55Q9D816 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyp2c55Q9D816 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cyp2c55Q9D816 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cyp2c55Q9D816 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms