Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rpap3Q9D706 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rpap3Q9D706 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rpap3Q9D706 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpap3Q9D706 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpap3Q9D706 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpap3Q9D706 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpap3Q9D706 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rpap3Q9D706 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpap3Q9D706 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpap3Q9D706 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpap3Q9D706 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpap3Q9D706 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpap3Q9D706 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rpap3Q9D706 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap3Q9D706 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap3Q9D706 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap3Q9D706 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap3Q9D706 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rpap3Q9D706 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rpap3Q9D706 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rpap3Q9D706 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rpap3Q9D706 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rpap3Q9D706 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rpap3Q9D706 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpap3Q9D706 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rpap3Q9D706 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rpap3Q9D706 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Rpap3Q9D706 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rpap3Q9D706 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rpap3Q9D706 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rpap3Q9D706 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rpap3Q9D706 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpap3Q9D706 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rpap3Q9D706 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rpap3Q9D706 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpap3Q9D706 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rpap3Q9D706 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpap3Q9D706 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rpap3Q9D706 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpap3Q9D706 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpap3Q9D706 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rpap3Q9D706 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rpap3Q9D706 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rpap3Q9D706 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Rpap3Q9D706 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rpap3Q9D706 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms