Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chchd2Q9D1L0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chchd2Q9D1L0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chchd2Q9D1L0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chchd2Q9D1L0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Chchd2Q9D1L0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chchd2Q9D1L0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chchd2Q9D1L0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chchd2Q9D1L0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chchd2Q9D1L0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chchd2Q9D1L0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chchd2Q9D1L0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chchd2Q9D1L0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chchd2Q9D1L0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chchd2Q9D1L0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chchd2Q9D1L0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chchd2Q9D1L0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chchd2Q9D1L0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chchd2Q9D1L0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chchd2Q9D1L0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chchd2Q9D1L0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chchd2Q9D1L0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chchd2Q9D1L0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chchd2Q9D1L0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chchd2Q9D1L0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chchd2Q9D1L0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms