Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Utp23Q9CX11 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Utp23Q9CX11 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Utp23Q9CX11 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Utp23Q9CX11 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Utp23Q9CX11 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Utp23Q9CX11 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms