Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx28Q9CWT6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx28Q9CWT6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddx28Q9CWT6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ddx28Q9CWT6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ddx28Q9CWT6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms