Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nicn1Q9CQM0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nicn1Q9CQM0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nicn1Q9CQM0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nicn1Q9CQM0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nicn1Q9CQM0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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