Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufb5Q9CQH3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufb5Q9CQH3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ndufb5Q9CQH3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndufb5Q9CQH3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndufb5Q9CQH3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ndufb5Q9CQH3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ndufb5Q9CQH3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ndufb5Q9CQH3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndufb5Q9CQH3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb5Q9CQH3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb5Q9CQH3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb5Q9CQH3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndufb5Q9CQH3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ndufb5Q9CQH3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufb5Q9CQH3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufb5Q9CQH3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ndufb5Q9CQH3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndufb5Q9CQH3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ndufb5Q9CQH3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ndufb5Q9CQH3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufb5Q9CQH3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndufb5Q9CQH3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufb5Q9CQH3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndufb5Q9CQH3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufb5Q9CQH3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufb5Q9CQH3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ndufb5Q9CQH3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufb5Q9CQH3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndufb5Q9CQH3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ndufb5Q9CQH3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufb5Q9CQH3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms