Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Med4Q9CQA5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Med4Q9CQA5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Med4Q9CQA5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Med4Q9CQA5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Med4Q9CQA5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Med4Q9CQA5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Med4Q9CQA5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Med4Q9CQA5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Med4Q9CQA5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Med4Q9CQA5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Med4Q9CQA5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Med4Q9CQA5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Med4Q9CQA5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Med4Q9CQA5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Med4Q9CQA5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Med4Q9CQA5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Med4Q9CQA5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Med4Q9CQA5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Med4Q9CQA5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Med4Q9CQA5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Med4Q9CQA5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Med4Q9CQA5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms