Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME7

Tbx19, T-box transcription factor TBX19, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx19Q99ME7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tbx19Q99ME7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tbx19Q99ME7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tbx19Q99ME7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Tbx19Q99ME7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tbx19Q99ME7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms