Protein–RNA interactions for Protein: Q99MD6

Txnrd3, Thioredoxin reductase 3, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd3Q99MD6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Txnrd3Q99MD6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Txnrd3Q99MD6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Txnrd3Q99MD6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Txnrd3Q99MD6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Txnrd3Q99MD6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Txnrd3Q99MD6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Txnrd3Q99MD6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Txnrd3Q99MD6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Txnrd3Q99MD6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Txnrd3Q99MD6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Txnrd3Q99MD6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Txnrd3Q99MD6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Txnrd3Q99MD6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Txnrd3Q99MD6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Txnrd3Q99MD6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Txnrd3Q99MD6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Txnrd3Q99MD6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Txnrd3Q99MD6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Txnrd3Q99MD6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Txnrd3Q99MD6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Txnrd3Q99MD6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Txnrd3Q99MD6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Txnrd3Q99MD6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Txnrd3Q99MD6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Txnrd3Q99MD6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Txnrd3Q99MD6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Txnrd3Q99MD6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Txnrd3Q99MD6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Txnrd3Q99MD6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Txnrd3Q99MD6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Txnrd3Q99MD6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Txnrd3Q99MD6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Txnrd3Q99MD6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txnrd3Q99MD6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txnrd3Q99MD6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txnrd3Q99MD6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txnrd3Q99MD6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Txnrd3Q99MD6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txnrd3Q99MD6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txnrd3Q99MD6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txnrd3Q99MD6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Txnrd3Q99MD6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Txnrd3Q99MD6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Txnrd3Q99MD6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms