Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fars2Q99M01 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fars2Q99M01 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fars2Q99M01 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fars2Q99M01 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fars2Q99M01 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms