Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TirapQ99JY1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TirapQ99JY1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TirapQ99JY1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TirapQ99JY1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms