Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rab29Q91YQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab29Q91YQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab29Q91YQ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab29Q91YQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rab29Q91YQ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab29Q91YQ1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab29Q91YQ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rab29Q91YQ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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