Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx15Q91WE1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx15Q91WE1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx15Q91WE1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx15Q91WE1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx15Q91WE1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx15Q91WE1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx15Q91WE1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx15Q91WE1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx15Q91WE1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx15Q91WE1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx15Q91WE1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Snx15Q91WE1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snx15Q91WE1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snx15Q91WE1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snx15Q91WE1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx15Q91WE1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx15Q91WE1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms