Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk8Q8R3L8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk8Q8R3L8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk8Q8R3L8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk8Q8R3L8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk8Q8R3L8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk8Q8R3L8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk8Q8R3L8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk8Q8R3L8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk8Q8R3L8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk8Q8R3L8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk8Q8R3L8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk8Q8R3L8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk8Q8R3L8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk8Q8R3L8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk8Q8R3L8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk8Q8R3L8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk8Q8R3L8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdk8Q8R3L8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdk8Q8R3L8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk8Q8R3L8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdk8Q8R3L8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk8Q8R3L8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk8Q8R3L8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk8Q8R3L8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk8Q8R3L8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk8Q8R3L8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk8Q8R3L8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk8Q8R3L8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk8Q8R3L8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk8Q8R3L8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdk8Q8R3L8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk8Q8R3L8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdk8Q8R3L8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk8Q8R3L8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk8Q8R3L8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk8Q8R3L8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk8Q8R3L8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk8Q8R3L8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk8Q8R3L8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk8Q8R3L8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdk8Q8R3L8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk8Q8R3L8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk8Q8R3L8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms