Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1H0

Hopx, Homeodomain-only protein, mousemouse

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HopxQ8R1H0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HopxQ8R1H0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HopxQ8R1H0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HopxQ8R1H0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HopxQ8R1H0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HopxQ8R1H0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HopxQ8R1H0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
HopxQ8R1H0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HopxQ8R1H0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HopxQ8R1H0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HopxQ8R1H0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HopxQ8R1H0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HopxQ8R1H0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HopxQ8R1H0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HopxQ8R1H0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HopxQ8R1H0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HopxQ8R1H0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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