Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SbsnQ8CIT9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SbsnQ8CIT9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SbsnQ8CIT9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SbsnQ8CIT9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SbsnQ8CIT9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SbsnQ8CIT9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbsnQ8CIT9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbsnQ8CIT9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbsnQ8CIT9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SbsnQ8CIT9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbsnQ8CIT9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbsnQ8CIT9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbsnQ8CIT9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SbsnQ8CIT9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SbsnQ8CIT9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SbsnQ8CIT9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms