Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx30Q8CE50 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx30Q8CE50 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx30Q8CE50 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx30Q8CE50 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx30Q8CE50 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx30Q8CE50 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx30Q8CE50 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx30Q8CE50 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx30Q8CE50 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx30Q8CE50 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx30Q8CE50 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx30Q8CE50 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx30Q8CE50 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx30Q8CE50 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx30Q8CE50 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx30Q8CE50 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx30Q8CE50 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx30Q8CE50 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms