Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam228aQ8CDW1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam228aQ8CDW1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam228aQ8CDW1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam228aQ8CDW1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam228aQ8CDW1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Fam228aQ8CDW1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228aQ8CDW1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228aQ8CDW1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228aQ8CDW1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228aQ8CDW1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam228aQ8CDW1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fam228aQ8CDW1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam228aQ8CDW1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam228aQ8CDW1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam228aQ8CDW1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam228aQ8CDW1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam228aQ8CDW1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam228aQ8CDW1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam228aQ8CDW1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam228aQ8CDW1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam228aQ8CDW1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam228aQ8CDW1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam228aQ8CDW1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228aQ8CDW1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228aQ8CDW1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228aQ8CDW1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228aQ8CDW1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fam228aQ8CDW1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fam228aQ8CDW1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms