Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rd3Q8BRE0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rd3Q8BRE0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rd3Q8BRE0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rd3Q8BRE0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rd3Q8BRE0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rd3Q8BRE0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rd3Q8BRE0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rd3Q8BRE0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rd3Q8BRE0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rd3Q8BRE0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rd3Q8BRE0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rd3Q8BRE0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms