Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TicrrQ8BQ33 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TicrrQ8BQ33 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TicrrQ8BQ33 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TicrrQ8BQ33 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TicrrQ8BQ33 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TicrrQ8BQ33 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TicrrQ8BQ33 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TicrrQ8BQ33 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TicrrQ8BQ33 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TicrrQ8BQ33 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TicrrQ8BQ33 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TicrrQ8BQ33 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TicrrQ8BQ33 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TicrrQ8BQ33 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TicrrQ8BQ33 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TicrrQ8BQ33 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TicrrQ8BQ33 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TicrrQ8BQ33 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TicrrQ8BQ33 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TicrrQ8BQ33 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TicrrQ8BQ33 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TicrrQ8BQ33 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TicrrQ8BQ33 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TicrrQ8BQ33 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TicrrQ8BQ33 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TicrrQ8BQ33 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TicrrQ8BQ33 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TicrrQ8BQ33 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TicrrQ8BQ33 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TicrrQ8BQ33 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TicrrQ8BQ33 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TicrrQ8BQ33 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TicrrQ8BQ33 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TicrrQ8BQ33 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TicrrQ8BQ33 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TicrrQ8BQ33 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TicrrQ8BQ33 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TicrrQ8BQ33 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TicrrQ8BQ33 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TicrrQ8BQ33 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TicrrQ8BQ33 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms