Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zcchc4Q8BKW4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zcchc4Q8BKW4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zcchc4Q8BKW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zcchc4Q8BKW4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zcchc4Q8BKW4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms