Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG26

Rusc1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc1Q8BG26 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc1Q8BG26 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc1Q8BG26 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rusc1Q8BG26 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc1Q8BG26 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc1Q8BG26 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rusc1Q8BG26 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rusc1Q8BG26 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rusc1Q8BG26 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc1Q8BG26 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rusc1Q8BG26 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rusc1Q8BG26 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rusc1Q8BG26 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rusc1Q8BG26 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rusc1Q8BG26 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rusc1Q8BG26 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rusc1Q8BG26 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rusc1Q8BG26 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rusc1Q8BG26 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rusc1Q8BG26 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rusc1Q8BG26 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rusc1Q8BG26 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Rusc1Q8BG26 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rusc1Q8BG26 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rusc1Q8BG26 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rusc1Q8BG26 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rusc1Q8BG26 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rusc1Q8BG26 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rusc1Q8BG26 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rusc1Q8BG26 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rusc1Q8BG26 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rusc1Q8BG26 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rusc1Q8BG26 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rusc1Q8BG26 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rusc1Q8BG26 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rusc1Q8BG26 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rusc1Q8BG26 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rusc1Q8BG26 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rusc1Q8BG26 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rusc1Q8BG26 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rusc1Q8BG26 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rusc1Q8BG26 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rusc1Q8BG26 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rusc1Q8BG26 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rusc1Q8BG26 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rusc1Q8BG26 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rusc1Q8BG26 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rusc1Q8BG26 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rusc1Q8BG26 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rusc1Q8BG26 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rusc1Q8BG26 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rusc1Q8BG26 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rusc1Q8BG26 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rusc1Q8BG26 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rusc1Q8BG26 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rusc1Q8BG26 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rusc1Q8BG26 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rusc1Q8BG26 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rusc1Q8BG26 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rusc1Q8BG26 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rusc1Q8BG26 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rusc1Q8BG26 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rusc1Q8BG26 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rusc1Q8BG26 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rusc1Q8BG26 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms