Protein–RNA interactions for Protein: Q80WR5

UPF0688 protein C1orf174 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80WR5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q80WR5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q80WR5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q80WR5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q80WR5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q80WR5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q80WR5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q80WR5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q80WR5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q80WR5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q80WR5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q80WR5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q80WR5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q80WR5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q80WR5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q80WR5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q80WR5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q80WR5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q80WR5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q80WR5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q80WR5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q80WR5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q80WR5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q80WR5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q80WR5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q80WR5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q80WR5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q80WR5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q80WR5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Q80WR5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q80WR5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q80WR5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q80WR5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q80WR5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q80WR5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q80WR5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q80WR5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q80WR5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q80WR5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q80WR5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q80WR5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q80WR5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q80WR5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q80WR5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q80WR5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q80WR5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q80WR5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q80WR5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q80WR5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q80WR5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q80WR5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q80WR5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q80WR5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q80WR5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q80WR5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q80WR5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q80WR5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q80WR5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q80WR5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q80WR5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q80WR5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q80WR5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q80WR5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q80WR5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q80WR5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q80WR5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q80WR5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q80WR5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q80WR5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q80WR5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q80WR5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q80WR5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q80WR5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q80WR5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q80WR5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q80WR5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q80WR5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q80WR5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q80WR5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q80WR5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q80WR5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q80WR5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q80WR5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q80WR5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q80WR5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q80WR5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80WR5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80WR5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80WR5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q80WR5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q80WR5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q80WR5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q80WR5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q80WR5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q80WR5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q80WR5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q80WR5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q80WR5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q80WR5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q80WR5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms