Protein–RNA interactions for Protein: Q80WB0

Fndc11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc11Q80WB0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fndc11Q80WB0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fndc11Q80WB0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fndc11Q80WB0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fndc11Q80WB0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc11Q80WB0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc11Q80WB0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc11Q80WB0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc11Q80WB0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc11Q80WB0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc11Q80WB0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc11Q80WB0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms