Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Acsm4Q80W40 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsm4Q80W40 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsm4Q80W40 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsm4Q80W40 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Acsm4Q80W40 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Acsm4Q80W40 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Acsm4Q80W40 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Acsm4Q80W40 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Acsm4Q80W40 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Acsm4Q80W40 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Acsm4Q80W40 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Acsm4Q80W40 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Acsm4Q80W40 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Acsm4Q80W40 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms