Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Phf8Q80TJ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Phf8Q80TJ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf8Q80TJ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf8Q80TJ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Phf8Q80TJ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Phf8Q80TJ7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms