Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Asic3Q6X1Y6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Asic3Q6X1Y6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Asic3Q6X1Y6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Asic3Q6X1Y6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Asic3Q6X1Y6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Asic3Q6X1Y6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Asic3Q6X1Y6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Asic3Q6X1Y6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Asic3Q6X1Y6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Asic3Q6X1Y6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Asic3Q6X1Y6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Asic3Q6X1Y6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Asic3Q6X1Y6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Asic3Q6X1Y6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Asic3Q6X1Y6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Asic3Q6X1Y6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Asic3Q6X1Y6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Asic3Q6X1Y6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Asic3Q6X1Y6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Asic3Q6X1Y6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Asic3Q6X1Y6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Asic3Q6X1Y6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Asic3Q6X1Y6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Asic3Q6X1Y6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Asic3Q6X1Y6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Asic3Q6X1Y6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Asic3Q6X1Y6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Asic3Q6X1Y6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Asic3Q6X1Y6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms