Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NfrkbQ6PIJ4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NfrkbQ6PIJ4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NfrkbQ6PIJ4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NfrkbQ6PIJ4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NfrkbQ6PIJ4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NfrkbQ6PIJ4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NfrkbQ6PIJ4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NfrkbQ6PIJ4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NfrkbQ6PIJ4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NfrkbQ6PIJ4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NfrkbQ6PIJ4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NfrkbQ6PIJ4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NfrkbQ6PIJ4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NfrkbQ6PIJ4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NfrkbQ6PIJ4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NfrkbQ6PIJ4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NfrkbQ6PIJ4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NfrkbQ6PIJ4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NfrkbQ6PIJ4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NfrkbQ6PIJ4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NfrkbQ6PIJ4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NfrkbQ6PIJ4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NfrkbQ6PIJ4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NfrkbQ6PIJ4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NfrkbQ6PIJ4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NfrkbQ6PIJ4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NfrkbQ6PIJ4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms