Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PdgfrlQ6PE55 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PdgfrlQ6PE55 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PdgfrlQ6PE55 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PdgfrlQ6PE55 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PdgfrlQ6PE55 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfrlQ6PE55 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PdgfrlQ6PE55 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PdgfrlQ6PE55 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PdgfrlQ6PE55 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PdgfrlQ6PE55 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdgfrlQ6PE55 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdgfrlQ6PE55 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdgfrlQ6PE55 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PdgfrlQ6PE55 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PdgfrlQ6PE55 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PdgfrlQ6PE55 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdgfrlQ6PE55 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms