Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDN3

Mylk, Myosin light chain kinase, smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MylkQ6PDN3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MylkQ6PDN3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MylkQ6PDN3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MylkQ6PDN3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MylkQ6PDN3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MylkQ6PDN3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MylkQ6PDN3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MylkQ6PDN3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MylkQ6PDN3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MylkQ6PDN3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MylkQ6PDN3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MylkQ6PDN3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MylkQ6PDN3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MylkQ6PDN3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MylkQ6PDN3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MylkQ6PDN3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MylkQ6PDN3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MylkQ6PDN3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MylkQ6PDN3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MylkQ6PDN3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MylkQ6PDN3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MylkQ6PDN3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MylkQ6PDN3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MylkQ6PDN3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MylkQ6PDN3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MylkQ6PDN3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MylkQ6PDN3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MylkQ6PDN3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MylkQ6PDN3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MylkQ6PDN3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MylkQ6PDN3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MylkQ6PDN3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MylkQ6PDN3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MylkQ6PDN3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MylkQ6PDN3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MylkQ6PDN3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MylkQ6PDN3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms