Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE3

Spin2c, Spindlin-2C, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2cQ6NVE3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Spin2cQ6NVE3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spin2cQ6NVE3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spin2cQ6NVE3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spin2cQ6NVE3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spin2cQ6NVE3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spin2cQ6NVE3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spin2cQ6NVE3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spin2cQ6NVE3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spin2cQ6NVE3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spin2cQ6NVE3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spin2cQ6NVE3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spin2cQ6NVE3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spin2cQ6NVE3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spin2cQ6NVE3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Spin2cQ6NVE3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spin2cQ6NVE3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spin2cQ6NVE3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms