Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
B4galnt3Q6L8S8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
B4galnt3Q6L8S8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
B4galnt3Q6L8S8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
B4galnt3Q6L8S8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
B4galnt3Q6L8S8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
B4galnt3Q6L8S8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
B4galnt3Q6L8S8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
B4galnt3Q6L8S8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
B4galnt3Q6L8S8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
B4galnt3Q6L8S8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4galnt3Q6L8S8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms