Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg16l2Q6KAU8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Atg16l2Q6KAU8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Atg16l2Q6KAU8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg16l2Q6KAU8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg16l2Q6KAU8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg16l2Q6KAU8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg16l2Q6KAU8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Atg16l2Q6KAU8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg16l2Q6KAU8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms