Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Znf280dQ68FE8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Znf280dQ68FE8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Znf280dQ68FE8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Znf280dQ68FE8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Znf280dQ68FE8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Znf280dQ68FE8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Znf280dQ68FE8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Znf280dQ68FE8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Znf280dQ68FE8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Znf280dQ68FE8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Znf280dQ68FE8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Znf280dQ68FE8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Znf280dQ68FE8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf280dQ68FE8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Znf280dQ68FE8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Znf280dQ68FE8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Znf280dQ68FE8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Znf280dQ68FE8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf280dQ68FE8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf280dQ68FE8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf280dQ68FE8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Znf280dQ68FE8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Znf280dQ68FE8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Znf280dQ68FE8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Znf280dQ68FE8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Znf280dQ68FE8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Znf280dQ68FE8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Znf280dQ68FE8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Znf280dQ68FE8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Znf280dQ68FE8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Znf280dQ68FE8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Znf280dQ68FE8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Znf280dQ68FE8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Znf280dQ68FE8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Znf280dQ68FE8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Znf280dQ68FE8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Znf280dQ68FE8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Znf280dQ68FE8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf280dQ68FE8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms